水草因种类不同，生长特性也有所差异，所以在种植时，也要注意这个问题，才不致于影响事后的生长状况。例如，有些水草在种植时，由于没有注意，种得太深，结果不发芽或导致腐烂；或由于种得太浅，被水流连根拔起。

一：小型的迷你种水草，可以直接用镊子夹住，逐株种入砂层中。　

1. 有茎水草的种植方法：有茎水草（如红蝴蝶）的种植最好先挖洞，再将其茎置入洞内并埋下砂中，比较不会伤到水草的插穗部分。另外，虽然以单株植入对未来的生长较为有利，但是若逐株种植则颇费人力，因此可以把洞稍为挖大一些，然后以3-5株为一束来种植。小型的迷你种水草，可以不用挖洞，直接用镊子夹住，逐株种入砂层中。此类水草可以种得深一些无妨。

二：莲座生无茎水草（如皇冠草）的种植方法。

2. 无茎水草的种植方法：某些莲座生无茎水草（如皇冠草）的种植最好也是先挖洞，再将其根部置入洞内并埋下砂中。种植时，以叶柄基部正好接触砂层表面最好，不要种得太深，以免发生腐烂的现象。尤其是新芽，更不可以被砂子完全掩盖。另一些根生无茎水草（如小水兰）的种植，可用食指尖将其根部轻压入砂中即可。

3. 块茎及球茎的种植方法：此类水草的种植，最好不要将整个块茎及球茎完全埋入砂中，否则可能无法长出叶芽，而导致腐烂。如果块茎或球茎没有长芽，可以使它在砂层表面出露1/3，如果附有叶芽者，种植时，以叶柄基部正好接触砂层表面最好。

三：莫丝鹿角苔最常使用的种植方法。

4. 其它水草的种植方法：像莫丝、鹿角苔一类水草的种植方法，可能需要使用特殊的技巧才能顺利种植。其中莫丝最常使用的种植方法，是使用细线将植物体捆绑在流木或岩石上。鹿角苔则是先使用网子或细线固定在一岩石或磁盘上，然后再放进入水族缸底床放置。此外，像铁皇冠、水榕类等水草，亦可使用细线将其走茎绑在流木或岩石上。