金鱼的发病原因很多，有些是因饲养管理不当引起，有些是因细菌、寄生虫感染所致，有些与长途运输有关。

（1）温差变化：金鱼在换水时，新旧水温相差5度或更多，常会引起鱼体不适，导致发病。尤其是在春季、秋季、和冬季，换水时要格外注意。

（2）水质变化：金鱼的饲水，由于投饵过多，残饵发酵引起水质变坏，如不及时换水，会诱发金鱼生病。此外，刚放出来的自来水，由于晾晒时间不够，金鱼放入后引起身体不适或中毒死亡。或是自来水中投放去氯药品大苏打数量过多，引起水质白浊，如不注意观察，会引起金鱼死亡，这种情况在高温天气尤多见。

（3）水土变化：金鱼经过长途运输，到达一个新的环境中，由于异地气候和水质差异，如果调理不当，会诱发金鱼生病。

（4）机械损伤：金鱼在日常捕捉或运输中，粗心大意或操作不当，导致金鱼鳞片脱落或器官损伤，如观察不及时，容易诱发金鱼生病。

（5）病菌感染：每年的春秋两季，是金鱼都会遇到的两个易发病的季节，这是自然环境引起的，人力难以抗拒，如果疾病判断不准确或用药不当，都会引起金鱼大批死亡。常见的寄生虫引起的烂鳃病、真菌引起的肤霉病、细菌引起的白头白嘴病和肠炎等。